Sự chính xác của xét nghiệm Covid-19 (RT-PCR) là bao nhiêu?
- Mùa hè năm 2020, bốn du khách Đức đến Bồ Đào Nha. Khi đến Bồ Đào Nha, họ được xét nghiệm Covid-19 và một trong 4 người bị dương tính mặc dầu trước đó 72 giờ họ được xét nghiệm tại Đức với âm tính. Cả 4 người đều bị cách ly 14 ngày. Lý do 3 người trong họ, âm tính, cũng bị cách ly là họ đi cùng với người dương tính, sẽ rất có thể cũng bị truyền nhiễm từ người đồng hành có dương tính.
Bốn người du lịch đó thưa kiện tại Lisbon, thủ đô Bồ Đào Nha, dựa trên những bài khảo cứu của tờ báo Lancet, và khuyến cáo của bộ y tế là khi xét nghiệm phải để ý thêm về người xét nghiệm có triệu chứng Covid-19 không, thẩm phán quyết định kết quả xét nghiệm chỉ đáng tin cậy khi “chu kỳ khuếch đại” của máy xét nghiệm là dưới 25.
https://www.theportugalnews.com/new...st-reliability-doubtful-portugal-judges/56962
- Tiểu bang Florida là tiểu bang đầu tiên tại Mỹ yêu cầu các trung tâm xét nghiệm Covid-19 phải đính kèm chỉ số chu kỳ (CT).
Một vài sự kiện cần biết để hiểu rõ hơn về vi khuẩn dịch
- Cơ thể con người có khuynh hướng đề kháng sự xâm nhập của virus, tùy theo sức đề kháng của mỗi người, sức đề kháng sẽ giết virus hoặc làm virus yếu đi, không đủ sức sinh sản và truyền nhiễm, giống như khi tiêm vaccine, một số ít virus (yếu) sẽ được đưa vào người để cơ thể đề kháng.
- Nếu virus trong cơ thể với số lượng ít, không sinh sôi nảy nở, bệnh nhân vẫn an toàn và không truyền nhiễm qua người khác.
- Nếu virus chết hoặc bị sức đề kháng làm yếu đi, virus sẽ vô hại và không truyền nhiễm.
Cách xét nghiệm Covid-19 bằng phương pháp PCR
Một que xét nghiệm được thọc sâu vào mũi hoặc cổ họng để lấy mẫu bệnh phẩm. Mẫu bệnh phẩm được rút hết chất béo và protein ra, trong mẫu bệnh phẩm chỉ còn RNA và vi khuẩn (nếu có) và nhiễu thể, mảnh vụn của virus (xác chết), và mẫu bệnh phẩm được tẩm một chất hóa học và được cho vào máy Thermal Cycler. Chất hóa học này sẽ tạo phản ứng với virus và phát sáng. Vì mẫu bệnh phẩm quá ít hoặc số lượng virus và mảnh vụn virus quá, máy không thể ghi nhận ánh sáng phát ra (quá yếu) của chất hóa học và virus kết hợp được. Máy phải khuếch đại số lượng phân tử của mẫu bệnh phẩm để có ánh sáng phát ra mạnh hơn để máy có thể ghi nhận được bằng cách tạo bản sao (gấp đôi): 1 thành 2, 2->4, 4->8, 8->16, 16->32, 32->64…… theo công thức đại số 2^n. Càng nhiều bản sao, ánh sáng của chất hóa học kết họp với virus càng mạnh cho tới khi máy ghi nhận được.
Giống như trong một bức ảnh có nhiều vật thể, nếu bạn muốn ghi nhận một vật thể rõ hơn, bạn khuếch đại ảnh lên (zoom in), nếu chưa rõ, khuếch đại thêm lần nữa. Vật thể nhỏ hơn, bạn cần khuếch đại nhiều lần hơn (phẩm chất sẽ kém đi).
Mỗi lần tạo một bản sao, người ta gọi là Cycles Threshold (CT), tạm dịch là chu kỳ. Con số chu kỳ này rất quan trọng. Nó cho biết số lượng nhiều ít của virus và mảnh vụn của virus trong mẫu phẩm bệnh. Số lượng này tỷ lệ nghịch với số chu kỳ. Số chu kỳ càng lớn, số virus trong mẫu bệnh phẩm càng nhỏ. Và ngược lại số chu kỳ càng nhỏ, số lượng virus trong mẫu bệnh phẩm càng nhiều
Số chu kỳ (số lần tạo bản sao) và số bản sao
2^1 = 2 bản sao
2^2 = 4 bản sao
2^3 = 8 bản sao
2^10 = 1024 bản sao
2^20 = 1.048.567 bản sao
2^25 = 33.554.432 bản sao.
2^30 = 1 tỷ bản sao
2^35 = 3,43 x 10^10 bản sao
2^40 = 1.09 x 10^12 bản sao
What is real time RT–PCR? How does it work with the coronavirus? And what does it have to do with nuclear technology? Here’s a handy overview of the technique, how it works and a few refresher details on viruses and genetics.
Cách đo độ chính xác của PCR
Lấy nhiều mẫu bệnh phẩm có cùng chu kỳ khuếch đại để trong phòng thí nghiệm trong một thời gian nhất định, chẳng hạn 8 ngày. Sau 8 ngày có bao nhiêu mẫu virus còn sống và sinh sản, và bao nhiêu mẫu virus bị chết.
Một bài biên khảo trên tờ New York Times ngày 29 tháng 8 năm 2020.
Thống kê người bị nhiễm Covid-19 thường không đăng tải con số chu kỳ (CT). Tại
Wadsworth Center, một phòng thí nghiệm nghiên cứu ca nhiễm với số
chu kỳ (CT) là 40 (tạo bản sao 40 lần, mỗi lần gấp đôi bản trước), và số mẫu bệnh phẩm bị
dương tính là 872. Tuy nhiên nếu những mẫu bệnh phẩm này có số chu kỳ (CT) là 35, số dương tính sẽ giảm 43%. Nếu số chu kỳ (CT) giảm xuống 30, số dương tính giảm 63%.
Tại tiểu bang Massachuttsets, số chu kỳ (CT) là 40. Nếu số chu kỳ (CT) giảm xuống 30, thì từ 85 đến 90% của ca nhiễm sẽ là
dương tính giả.
https://www.nytimes.com/2020/08/29/health/coronavirus-testing.html
Nhiều cơ quan nghiên cứu xét nghiệm Covid-19 bằng phương pháp RT-PCR khuyến cáo không nên dùng
số chu kỳ lớn hơn 30 vì kết quả đại đa số là dương tính giả, không có giá trị.
Tuy nhiên, trong một bài khảo cứu đăng trên tờ Clinical Infectious Diseases, tác giả nghiên cứu nói những người có dương tính với số chu kỳ lớn hơn 25 sẽ không truyền nhiễm qua người khác qua kết quả tại phòng thí nghiệm. Các nhà nghiên cứu gồm
Rita Jaafar,
Sarah Aherfi,
Nathalie Wurtz,
Clio Grimaldier,
Thuan Van Hoang,
Philippe Colson,
Didier Raoult,
Bernard La Scola đã thực hiện
250.566 cuộc xét nghiệm SARS-CoV-2 RT-PCR cho 179.151 bệnh nhân. Với 3790 mẫu bệnh phẩm và với chu kỳ (CT) 25, số dương tính là 70%, với chu kỳ 30 số dương tính giảm xuống còn 20%. Với chu kỳ 35, số dương tính chỉ còn khoảng 3%.
https://academic.oup.com/cid/advance-article/doi/10.1093/cid/ciaa1491/5912603
Ngoài ra hồi tháng 8 năm 2020 CDC Mỹ công bố chỉ có 6% số tử vong Covid-19 là chết thuần vì Covid-19, 94% số còn lại là chết vì có bệnh nền.
Tại sao có sự chênh lệch kết quả quá lớn giữa các chu kỳ (CT) như vậy?
Sự khuếch đại từ chu kỳ 30 tới chu kỳ 40 là 1.024 lần (2^10 = 1024).
Hầu hết việc xét nghiệm Covid-19 tại Mỹ, phương pháp RT-PCR có chỉ số chu kỳ (CT) từ 35 tới 40 nên con số ca nhiễm Covid-19 trong những tháng gần đây tăng kỷ lục, khủng khiếp. Tất cá phương pháp phòng chống Covid-19, luật lockdown, đeo khẩu trang, cách ly, đóng cửa trường học, nhà hàng… đều dựa vào số ca nhiễm Covid-19.
Không biết Việt Nam dùng chỉ số chu kỳ (CT) nào.