Total War: THREE KINGDOMS - Chủ đề trung tâm của cốt truyện dựa trên một câu nói nổi tiếng: “Cái gì hợp lâu sẽ tan, cái gì tan lâu sẽ hợp”. Một đế chế được hưởng nhiều thế kỷ thịnh vượng sẽ chia thành nhiều lãnh địa khác nhau được cai trị bởi các lãnh chúa và gia tộc cho đến thời điểm đó chỉ còn lại ba vương quốc. Từ đó, ba phe phái này sẽ trải qua cuộc xung đột nội bộ và bên ngoài của chính họ cho đến khi đất được thống nhất một lần nữa.
Câu chuyện diễn ra ở Trung Quốc từ năm 169 đến 280 sau Công nguyên khi triều đại nhà Hán đang đi đến giai đoạn cuối cùng của thời kỳ cai trị của mình, đồng thời nổi lên giặc khăn vàng do Trương Giác cầm đầu. Đối đầu với Trương Giác và đội quân bao gồm hàng ngàn nông dân điên cuồng và những kẻ lang thang là sức mạnh của Quân đội Hoàng gia và các chỉ huy khác nhau – Lưu Bị, Tào Tháo, Tôn Kiên, Đổng Trác, và Lữ Bố. Chống lại những người vĩ đại nhất trong độ tuổi, Trương Giác và giặc khăn vàng không thể làm gì ngoài việc bị nhấn chìm. Thật không may, biến động lớn này sẽ dẫn đến nhiều thay đổi lớn lao tiếp theo trong lịch sử.